Новости коронавируса

[• neksia160]

По прогнозам один из благоприятных сценариев : вирус более контактен , но последствия гораздо легче , чем у Дельты. Возможно он ослабевает. Но это всего лишь один из прогнозов.

[• Anti Fake]

Готовься к худшему, надейся на лучшее:

В 7:30 утра в среду Кристиан Андерсен, исследователь инфекционных заболеваний в Scripps Research в Сан-Диего, получил сообщение в Slack: «Этот вариант совершенно безумный». Так Эндрю Рамбо из Эдинбургского университета отреагировал на новую последовательность генома SARS-CoV-2, обнаруженную в трех образцах, собранных в Ботсване 11 ноября, и в одном, полученном от путешественника из Южной Африки спустя неделю пребывания в Гонконге.
Андерсен посмотрел на показатели, а затем ответил: «Черт возьми, это нечто. Длина этой ветви...» Через несколько минут он добавил: «Просто взглянул на список мутаций — это какое-то сумасшествие».
Они говорили о том, что теперь называется «омикрон» — новый вариант, вызывающий опасения, и длинная ветвь, которую заметил Андерсен, относится к его расстоянию до любого другого известного штамма вируса на древе эволюции SARS-CoV-2. Этот вариант, по-видимому, собрал десятки мутаций, многие из которых известны своей ролью в защите от иммунитета или повышении трансмиссивности, и для которых не найдены промежуточные последовательности в базе данных, содержащей миллионы вирусных геномов. Во вторник, обнаружив странные последовательности во всемирной базе данных, Том Пикок, вирусолог из Имперского колледжа Лондона, уже опубликовал свой собственный вердикт на GitHub: «Это может вызвать серьезную обеспокоенность».
Теперь в очередной раз мир наблюдает, как исследователи работают без перерыва, чтобы узнать, что готовит человечеству новый вариант. Омикрон более контагиозный? Более смертоносный? Проще ли он переносится при повторном заражении выздоровевших людей? Насколько он устойчив к вакцине? И откуда он вообще взялся? «Чтобы это выяснить, потребуется время», — предупреждает Джереми Фаррар, глава Wellcome Trust. «Боюсь, терпение имеет решающее значение».
Исследователи в Южной Африке уже вышли на след нового штамма. Несколько групп независимо друг от друга пытались выяснить, почему случаи заболевания участились в Гаутенге, северной провинции, включающей Йоханнесбург и Преторию. Частная лаборатория под названием Lancet заметила, что обычные ПЦР-тесты на SARS-CoV-2 не смогли обнаружить ключевой признак, ген S, во многих образцах — явление, ранее наблюдавшееся с альфа-штаммом, — что является еще одним поводом для беспокойства. Когда исследователи из Lancet секвенировали восемь из этих вирусов, они выяснили почему: геном был настолько сильно мутирован, что тест пропустил ген.
Lancet поделился геномами с Сетью геномного надзора ЮАР (NGS-SA), которая созвала срочное совещание во вторник. «Мы были шокированы количеством мутаций», — говорит Тулио де Оливейра, вирусолог из Университета Квазулу-Натал и главный исследователь NGS-SA. По словам де Оливейры, после встречи он позвонил генеральному директору здравоохранения Южной Африки и «попросил его проинформировать министра и президента о появлении потенциального нового штамма». В течение следующих 24 часов команда секвенировала еще 100 случайно выбранных последовательностей из Гаутенга. Все они демонстрировали одну и ту же картину. Проинформировав правительство, де Оливейра и его коллеги представили свои доказательства на пресс-конференции в четверг утром. В пятницу Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) назвала вирус «вариантом, вызывающим озабоченность» и окрестила его омикроном. (Названия вариантов следуют греческому алфавиту, но ВОЗ пропустила буквы Nu и Xi, потому что Nu слишком легко спутать со словом new — «новый», а Xi — распространенная фамилия).
Одна из причин беспокойства по поводу омикрона заключается в том, что, как показывают результаты секвенирования образцов, штамм быстро вытеснил другие варианты
© https://threadreaderapp.com/thread/1463885539619311616.html в Южной Африке. Но эта картина может быть искажена. Во-первых, секвенирование, возможно, было сосредоточено на возможных случаях нового варианта в последние дни, что может привести к видимому увеличению частоты встречаемости по сравнению с реальной ситуацией. Данные ПЦР обеспечивают более широкий охват и дают менее предвзятое представление, но и там образцы с дефектом гена S указывают на быстрое размножение омикрона.
Но рост частоты встречаемости все еще может быть обусловлен случайностью. В Сан-Диего серия случаев заражения вирусом в университете привела к вспышке одного конкретного штамма SARS-CoV-2 в начале этого года, говорит Андерсен: «Это были тысячи случаев, и все они были вызваны одним и тем же вирусом». Но штамм оказался не таким контагиозным, как предполагалось. В последнее время в Южной Африке было зарегистрировано относительно мало случаев заболевания, поэтому серия случаев с быстрым распространением могла привести к росту заболеваемости, вызванной новым штаммом. «Я подозреваю, что многое из этого сообщения объясняется такими соображениями, и я отчаянно на это надеюсь», — говорит Андерсен. Основываясь на сравнении различных геномов омикрона, Андерсен считает, что вирус появился где-то в конце сентября или начале октября, что говорит о том, что он может распространяться медленнее, чем кажется.
Его S-белок, который прикрепляется к клеткам за счет связывания с рецепторами на их поверхности, имеет 30 аминокислотных отличий от исходного уханьского вируса. Кроме того, в трех местах аминокислоты исчезли, а в одном месте появились новые (другие белки тоже претерпели изменения). Многие изменения в белке происходят вокруг рецептор-связывающего домена — части белка, которая вступает в контакт с клеткой человека. «Это очень беспокоит», — говорит Фаррар. Генетическое картирование, проведенное в прошлом году, показало, что некоторые из этих изменений значительно улучшили связывание вируса с рецептором.
По словам Ариса Кацуракиса, биолога-эволюциониста из Оксфордского университета, на основе одних только мутаций трудно сказать, насколько контагиозен вирус. «Но если бы мы искали мутации, которые действительно влияют на трансмиссивность, у него есть все из них», — говорит он.
«Последовательность также предполагает, что вирус может превосходно уклоняться от человеческих антител», — говорит Джесси Блум, биолог-эволюционист из Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона. Иммунная система человека вырабатывает множество различных антител, которые могут нейтрализовать SARS-CoV-2, но многие из числа наиболее важных делятся на три категории, называемые просто 1, 2 и 3, каждая из которых нацелена на несколько разные участки S-белка вируса. Мутация под названием E484K уже давно вызывает беспокойство, потому что она изменяет форму сайта, распознаваемого антителами класса 2, делая их менее активными. Омикрон в этом сайте несет мутацию под названием E484A, а также аналогичные изменения в сайтах для двух других классов антител.
Блум считает, что люди, которые переболели COVID или были вакцинированы, вряд ли полностью утратят способность нейтрализовать вирус. «Но я бы ожидал, что снижение нейтрализации будет более выраженным, нежели для других штаммов, если основываться на данной комбинации мутаций».
Эксперименты в лаборатории покажут, прав ли Блум. Алекс Сигал, изучающий инфекционные заболевания в Институте исследований здравоохранения Африки, говорит, что в среду он получил мазки с oмикроном и начал культивировать вирус. По его словам, на производство достаточного количества вируса для тестирования на сыворотке вакцинированных и выздоровевших людей потребуется пара недель. Другие исследователи будут тестировать вирусы, генетически сконструированные так, чтобы они несли только спайковый белок oмикрона; этот процесс осуществляется быстрее, чем выращивание самого штамма, но немного дольше того, что происходит в реальной жизни.
По словам Фаррара, по мере проведения таких исследований крайне важно внимательно отслеживать любые изменения в пандемии. «Видите ли вы, что число случаев заболевания растет не только в Южной Африке, но и в более широком регионе?» Фаррар отмечает, что вирус уже был выявлен в Бельгии, Соединенном Королевстве и Израиле и, вероятно, будет обнаружен и в других местах. «Видите ли вы увеличение числа случаев в других частях мира вокруг предполагаемых источников заболевания?» Эпидемиологи также будут следить за изменениями в тяжести заболевания — сколько людей госпитализировано и умирает. Все это потребует времени.
Между тем, Европейский Союз, Соединенные Штаты и многие другие страны ограничили поездки в Южную Африку и обратно в попытке защитить себя. По словам Фаррара, ограничения на поездки вряд ли остановят новый штамм, но это может помочь выиграть время. «Вопрос в том, что вы тогда будете делать со временем».
Ограничения поездок связаны с экономическими и социальными издержками, что может стать препятствием для сообщения о новых вариантах. «Я слышал, что страны не очень быстро распространяли информацию о появлении новых вариантов вируса [в прошлом], потому что они беспокоились о запретах на поездки», — говорит Эмма Ходкрофт, вирусолог из Бернского университета. «Это противоречит тому, чего мы хотим».
«Подобные соображения не остановили южноафриканских исследователей», — говорит де Оливейра. «Мы действительно рискуем получить массовую негативную реакцию в случае, если [омикрон] не вызовет массовой волны инфекции и ее удастся взять под контроль», — написал он в сообщении. «Но это риск, с которым я готов жить, поскольку пандемия вызвала так много смертей и страданий. [Мы] надеемся, что наша ранняя идентификация поможет всему миру».

© https://medach.pro/post/2746

--------------------

Tinkoff: бесплатные навсегда дебетовая Black (по 28.02.22 после покупки от 300₽) и кредитная Platinum (по 31.01.22).

[• Anti Fake]

Необычно большое количество детей в возрасте до пяти лет начало поступать в больницы ЮАР в связи с фиксируемой в стране новой вспышкой коронавируса, вызванной омикрон-штаммом. Об этом сообщила в среду Рудо Матива, которая руководит отделением интенсивной терапии одной из крупнейших в ЮАР больниц "Крис Хани Барагванат" в городе Йоханнесбург.
"Число больных, поступающих в больницы, растет в геометрической прогрессии, - заявила она в эфире местного телеканала eNCA. - Одновременно мы наблюдаем изменение в демографическом профиле пациентов, что вызывает повышенную тревогу. В больницы все больше доставляют детей в возрасте до пяти лет с симптомами коронавируса. Им требуется лечение, в частности дополнительный кислород".
Накануне сотрудница Национального института инфекционных заболеваний (НИИЗ) Васила Джасат сообщила, что необычно большое число детей в возрасте до двух лет поступает сейчас в больницы столицы ЮАР Претории с диагнозом "коронавирус".
"За последние дни в агломерации Тсване, куда входит Претория, были госпитализированы 52 ребенка до двух лет с COVID-19, - цитирует ее слова радиостанция SABC. - Пока в этой возрастной группе зафиксирован один летальный исход". По ее словам, среди пациентов, помещенных в больницы Тсване с коронавирусом, на малолетних детей приходится 10%.
Тревожная статистика
За прошедшие сутки в ЮАР произошел резкий, почти в два раза рост числа новых случаев заражения коронавирусом - до 4 373 заболевших по сравнению с 2 273 накануне. Наибольший прирост числа пациентов продолжает отмечаться в столичной провинции Гаутенг - 3 143 по сравнению с 1 909 накануне. НИИЗ не раскрывает, сколько среди новых заболевших тех, кто инфицирован омикрон-штаммом. В минувшее воскресенье президент ЮАР Сирил Рамапоса заявил, что за последние дни в Гаутенге большинство заболевших ковидом инфицированы омикрон-штаммом.
За прошедшие сутки были сделаны 42 664 ПЦР-теста, доля их положительных результатов достигла 10,2%.
В больницы с диагнозом COVID-19 были помещены 119 человек по сравнению с 79 днем ранее. Сейчас общее число пациентов, госпитализированных с коронавирусом, составляет 2 328. Число летальных исходов за сутки составило 21. Количество больных, у которых COVID-19 находится в активной фазе, составляет 28 651.

© https://tass.ru/obschestvo/13077279

--------------------

Tinkoff: бесплатные навсегда дебетовая Black (по 28.02.22 после покупки от 300₽) и кредитная Platinum (по 31.01.22).

[• Anti Fake]

Большое интервью с Константином Севериновым (все копировать не стал, только по омикрону):

«Есть основания полагать, что новый вариант вируса способен вытеснять «Дельту»

— Константин Викторович, известия о новом штамме коронавируса — «Омикроне» — спровоцировали панику во всем мире. ВОЗ и Роспотребнадзор бьют тревогу, что вероятность его распространения на глобальном уровне очень высока, так как он может быть более заразным. Многие страны закрывают авиасообщения с африканскими государствами, где был обнаружен новый штамм. Отменяются спортивные соревнования. Насколько все это оправданно?
— Опыт пандемии показывает, что недооценивать вирус не стоит, но также говорит о том, что (цитируя мэра Нью-Йорка Билла де Блазио) надо надеяться на лучшее, но готовиться к худшему. Есть основания полагать, что новый вариант вируса, возможно, более заразен и способен вытеснять «Дельту», которая, в свою очередь, вытеснила все более ранние варианты вируса и доминирует сейчас на всей планете. Это плохая новость. Но это еще не точно. Никаких данных о том, что «Омикрон» приводит к более тяжелому течению заболевания, или, например, что инфекция, вызванная этим вариантом, хуже купируется антителами, выработанными на действующие вакцины, нет. Ответ на вопрос об эффективности вакцин будет получен в ближайшие несколько недель.
Для того, чтобы оценить, меняет ли новый вариант тяжесть течения заболевания, потребуется больше времени.
Так как очевидно, что новый вирус вместе с его носителями распространяется в Америке, Азии и Европе и обнаружен там же, то повод для принятия каких-то действий, безусловно, существует. Напомню, что вариант «Дельта», который был просмотрен нашей эпидемиологической службой в апреле и мае прошлого года, появился как бы вдруг в июне и привел к серьезной вспышке летом и к гораздо более тяжелой — осенью, которая пока что еще не закончилась.
— Меры, которые сейчас принимает Россия, тоже оправданны, хотя «Омикрон» у нас, как заверяют в Роспотребнадзоре, еще не обнаружен?
— Я, к сожалению, не знаком с мерами, которые принимает наша страна, но могу себе представить. Чиновники всех стран используют одни и те же методы. В частности, пытаются закрыть или ограничить авиасообщение с африканскими странами, с той же ЮАР. В лучшем случае таким образом удастся выиграть время — будет возможность подождать и посмотреть, когда откуда-нибудь появятся точные данные о новом штамме. Но предотвратить его приход в Россию в любом случае не удастся. Выиграть некоторое количество времени важно: если новый штамм окажется более опасным, то медицинская система, возможно, сумеет подготовиться к встрече.
— Россия не только закрывает авиасообщение. Путин еще дал распоряжение обновить план по противодействию ковиду в связи с «Омикроном». И прибывающих в РФ из стран, где он обнаружен, отправляют на карантин. Срок действия результата ПЦР-теста сокращается с 78 до 48 часов. В больницах не сворачивают резервные койки. И это при том что «Омикрон» еще не изучен.
— Реакция на уровне срока сокращения действия результата ПЦР-теста ни на чем не основана. Но иметь план действий в случае возникновения более опасного варианта вируса, чего исключить нельзя, очень полезно в принципе не для «Омикрона», а для какого-то другого варианта, если он вдруг возникнет.
— Можно ли прогнозировать, как быстро «Омикрон» может попасть в Россию, распространиться? Вызовет ли он очередную вспышку заболевания?
— Ответить на этот вопрос не может никто. Будущее нельзя предсказать. Есть ряд параметров, которые надо принимать во внимание. Первое — это инфекционность нового варианта по отношению к исходному (сейчас это «Дельта», поскольку доминирует глобально) и наличие каких-то других преимуществ, которые могут позволить вытеснить исходный вариант. Второе — тяжесть заболевания, вызванная новым вариантом. И третье — это способность нового варианта выходить из-под действия иммунного ответа, вызванного существующими вакцинами. Для «Омикрона» четкого ответа (ни положительного, ни отрицательного) ни на один из этих вопросов в настоящее время нет.

«Варианты вируса конкурируют друг с другом за возможность заразить людей»

— Что на сегодня мы точно знаем об «Омикроне» и какие можем сделать заключения?
— Можно обсуждать возможные гипотетические сценарии. Так как мы находимся в самом начале процесса, реальных ответов нет и сказать, какой сценарий развития событий более вероятен, нельзя. Можно представить, что к концу декабря – началу января мы увидим, что частота заражения новым вариантом повышается не только в ЮАР, но и в других странах. А может быть, он исчезнет, и мы забудем об «Омикроне».
Помните, несколько месяцев назад был вариант «Лямбда»? О нем же никто не говорит сейчас. Первые данные о возможностях «Омикрона» уходить от иммунного ответа, думаю, будут получены буквально в течение недели-двух. Ответ легко получить, делая простые опыты по инактивации вируса в лабораторных условиях сыворотками крови вакцинированных людей. Скорее всего, первые результаты придут именно из ЮАР, ведь у них есть новый вариант вируса, а он необходим для проведения опытов. В ЮАР используются вакцины AstraZeneca, Johnson & Johnson, Pfizer, и для каждой из них будут получены данные.
А для того, чтобы достоверно оценить тяжесть заболевания зараженных «Омикроном», им должно заболеть достаточно большое количество людей. Затем врачи должны будут собрать статистически достоверные данные о тяжести течения болезни по сравнению с пораженными «Дельтой». На это уйдет время.
— Уже сообщается, что в ЮАР 75 процентов всех подтверждаемых случаев инфицирования — это «Омикрон», так во всяком случае в провинции Гаутенг, где он был обнаружен. Президент ЮАР заявил, что число случаев подтверждения инфицирования в стране менее чем за неделю выросло в 4,5 раза. Почему такой большой скачок, почему там доминирует «Омикрон»?
— ЮАР далеко, мы пока не знаем, насколько этим данным можно доверять. Поэтому все и волнуются.
— Звучат разные предположения и по поводу происхождения «Омикрона».
— Механизм происхождения данного штамма, мне кажется, не подвергается сомнению. Эволюцию вируса — естественный процесс, его нельзя остановить. Появление нового варианта ожидалось. Но, учитывая то, что глобально сейчас доминирует «Дельта», можно было представить, что следующий вирус окажется ее вариантом, если хотите, «супердельтой». Такой вирус содержал бы все те изменения, которые есть у «Дельты». Плюс еще какие-то дополнительные мутации, которые возникали в результате естественного отбора.
Но вариант «Омикрон» не является вариантом «Дельты», он возник независимо. Некоторые мутации «Омикрона» такие же, как некоторые мутации «Дельты», некоторые — как отдельные мутации бета-варианта, а некоторые совершенно новые. Поэтому «Омикрон» «Дельте» не сыночек, не внучок и не правнучек.
Возникновение вируса с множественными мутациями не может произойти мгновенно. Мы можем представить последовательное возникновение множественного мутанта за счет накопления первой, второй, третьей, четвертой, пятой и далее по списку — до пятидесятой замены (именно столько изменений у «Омикрона»по сравнению с уханьским вариантом, с которого началась эпидемия). Если бы процесс последовательного накопления мутаций происходил на фоне реинфекции промежуточными формами людей, то эпидемиологи увидели бы людей, зараженных вирусами с промежуточными наборами мутаций. Такого не было. Как будто бы вирус возник сразу со всеми своими мутациями.
Механизм такого «внезапного» появления множественных мутаций описан, причем несколько раз, в частности группой российских ученых при исследовании пациентки из Санкт-Петербурга, у которой был долгий ковид на фоне иммуносупрессии. Люди с подавленной иммунной системой могут болеть коронавирусной инфекцией долго. Они не могут избавиться от вируса, но и не умирают. В организме таких людей вирус в течение длительного времени приспосабливается к тому не полностью напряженному иммунному ответу, который у них есть (людей совсем без иммунного ответа нет, они умирают в младенчестве).
Приспосабливаясь к частичному иммунному ответу пациента, вирус набирает большое количество мутаций в ходе множественных циклов заражения и перезаражения клеток инфицированного человека. В конечном счете такой вирус может выйти наружу и начать заражать других людей. Но само по себе большое количество мутаций вовсе не означает, что вирус особенно опасен. В упомянутом случае пациентки из Санкт-Петербурга множественные мутации были, но вирус оказался не жилец. Он не обладал никакими преимуществами по сравнению с «Дельтой», которая в это время заражала других петербуржцев.
— Высказывалось суждение, что «Омикрон» мог возникнуть из-за того, что в ЮАР и Ботсване людей массово лечили плазмой переболевших COVID-19.
— Данных о том, что это так, нет. Это просто мнения. Сомневаюсь, что эксперты, которые делают эти утверждения, имеют данные о реальной частоте использования плазмы переболевших в ЮАР.
— Звучали также предположения, что «Омикрон» мог сформироваться в организме человека, страдающего СПИДом, так как у него ослабленный иммунитет.
— Одним из вариантов подавленного иммунитета является иммунодефицит, вызванный ВИЧ. В Африке процент ВИЦ-инфицированных выше, чем во многих других странах. Но это не означает, что «Омикрон» возник именно так.
— А мог ли новый штамм появиться на фоне постковидного синдрома от человека со слабым иммунитетом после перенесенного заболевания?
— Постковидный синдром появляется у человека, который уже выздоровел. У таких людей уже нет вируса, они просто страдают от последствий перенесенной инфекции. А долгий ковид — это когда человек реально болеет, вирус в нем существует в течение длительного времени.
— Кстати, недавно в одном из утренних ток-шоу о здоровье говорили о том, что при постковиде вирус все равно остается где-то в клетках.
— Это утверждение на совести тех, кто его сделал. Данных, что так бывает, нет.
— Большое количество мутаций «Омикрона» может дать самому вирусу как преимущество, так и ослабить его?
— Да. Он может стать менее приспособленным по сравнению с существующим доминирующим вирусом «Дельта». На самом деле варианты вируса борются между собой, конкурируют друг с другом за возможность заразить людей.
— А «Омикрон» может быть более патогенным за счет того, что у него много мутаций?
— Мутации не возникают с какой-то целью, они появляются случайно. Наличие мутаций и их количество не связаны напрямую с патогенностью. Возможно, часть изменений «Омикрона» возникла в результате приспособления к нашему иммунному ответу. Тогда это плохая новость. Но есть масса мутаций, которые возникают без всякой видимой причины, не приносят никакой пользы и тем не менее иногда они закрепляются в популяции.
— Африканские врачи отмечают, что у «Омикрона» нетипичные симптомы. Например, у больных не пропадает обоняние и вкус, но наблюдается сильная усталость.
— Такие утверждения можно делать на основании изучения большого количества больных, которых пока нет. У людей могут быть просто ощущения. Понятно, что практическая медицина крайне важна и является источником очень необходимых данных. Но считать, что «Омикрон» проявляется именно так, как сейчас рассказывают врачи из ЮАР, преждевременно.
— То есть рассказы о сильной усталости, что молодые мужчины не могут даже встать со стула…
— Все это ни о чем. Это скорее повод для новых публикаций в СМИ, которые, безусловно, делают важную работу по распространению последней информации о коронавирусе. Но параллельно с этим есть масса шелухи. Ведь фактически идет перепечатка информации без попытки ее критически осмыслить.
— В новостях еще подавалось как нечто необычное, что «Омикрон» обладает симптомами гриппа…
— Симптомы гриппа неспецифичны, многие пересекаются с симптомами COVID-19.
— Это так. Кстати, встречаются разные сообщения и о тяжести заболевания. Писали, что оно протекает и легко, и тяжело.
— Мы с вами говорим о варианте, который был идентифицирован в начале ноября и на сегодня никаких достоверных данных о нем нет. Когда делаются такого рода утверждения, их авторы, как правило, неизвестны. В научной печати сообщений, которые были бы оценены экспертами, нет. Поэтому и достоверные ответы отсутствуют.

«Все прививки, разработанные на основании исходного, уханьского, варианта, подавляют и другие варианты»

— Пока не зафиксировано смертельных случаев у заболевших «Омикроном». Значит, нельзя оценить, какой может быть летальность?
— Раз не зафиксировано смертей, как можно сказать, что у него повышенная или пониженная летальность? По сравнению с чем?
— Главный научный сотрудник НИЦ эпидемиологии и микробиологии имени Гамалеи, вирусолог Анатолий Альтштейн выразил надежду, что «Омикрон» вообще не смертоносен.
— Анатолий Давидович высказал мнение и, наверное, надежду. А она, как известно, умирает последней. И он, и я, и любой другой может выражать свои позиции. Ни на чем не основанные мнения не более ценны, чем предсказания гадалки. Все может быть.
— Врачи из ЮАР еще рассказывают, что «Омикрон» быстро распространяется среди людей в возрасте от 20 до 30 лет, переболевших ковидом. В ВОЗ предупреждают, что у переболевших повышенный риск заразиться штаммом «Омикрон». В Роспотребнадзоре допустили, что новый штамм может снижать эффективность антител переболевших.
— По сравнению с уханьским вариантом у «Омикрона» большое количество замен в S-белке короны. Антитела, которые вырабатываются нашим организмом в ответ на инфекцию или вакцинацию, взаимодействуют с S-белком и за счет этого нейтрализует вирус. Так как у «Омикрона» изменений в S-белке больше, чем у любого из известных вариантов, то можно предположить, что иммунный ответ будет сниженным. Насколько он будет сниженным, мы не знаем. Например, вариант «Дельта» тоже имеет существенное количество отличий в S-белке по сравнению с уханьским вариантом. И «Дельта» действительно несколько менее эффективно нейтрализуется антителами, возникшими на большинство существующих вакцин. Но вакцины, безусловно, снижают вероятность заразиться «Дельтой», а в случае заражения снижают вероятность тяжелого течения заболевания.
— Может ли «Омикрон» заражать людей, у которых есть иммунитет к другим штаммам?
— Это неизвестно. Пробивные инфекции у вакцинированных или переболевших известны и для существующих вариантов вируса. Их мало, но они есть.
Для того, чтобы понять, насколько все это правда, нужно иметь какую-то группу сравнения, знать, когда конкретные люди, которые якобы заболели этим вирусом, переболели или вакцинировались, сколько времени прошло до того, как они заразились, и так далее и тому подобное. Дьявол кроется в деталях. Очень просто сделать ни на чем не основанное утверждение. Но сделать доказательное утверждение очень сложно, для него требуются исследования и время.
— Врачи из ЮАР также отмечают вероятность осложнений при заражении вариантом «Омикрон» у пожилых людей, страдающих диабетом или сердечно-сосудистыми заболеваниями. Но такие риски и у «Дельты». Можно ли предположить, что «Омикрон» будет провоцировать серьезные заболевания, способные приводить к смерти?
— Более тяжелое течение заболевания COVID-19 вообще характерно для людей пожилых, страдающих ожирением и прочим.
Есть такое из детства: «А если бы он нес патроны?» Такое сложно комментировать. Фактов нет. Как ученый, я могу обсуждать только факты. Вы же приводите целый букет всяких возможностей и страшилок. Если какой-нибудь из этих апокалипсических сценариев верен, то, наверное, лучше быть к нему готовым. В России «Омикрон», конечно же, есть, но он очень редок, и, возможно, таким и останется. Но есть риск, что он начнет распространяться с неизвестными последствиями. Лучшее, что может сделать в такой ситуации любой человек, который заботится о себе и своих близких и даже неблизких, — это вакцинироваться, если он или она еще этого не сделал. Или ревакцинироваться, если пришло время. Больше ничего сделать пока нельзя.
— Премьер-министр Великобритании заявил, что «Омикрон» способен распространяться между полностью привитыми людьми. В связи с этим опять начались обсуждения, что существующие вакцины будут вообще бесполезны или их эффективность снизится. Уже называют цифры в 15 процентов.
— Никаких цифр на данный момент названо быть не может, потому что нет данных. Мнение премьер-министра не является профессиональным, но его слова могут убедить кого-то сделать решения о прививке. И слава богу!
— Но, например, профессор Школы системной биологии Университета Джорджа Мейсона (США) Анча Баранова обратила внимание на то, что госпитализированные с «Омикроном» пациенты в Гонконге были полностью провакцинированными.
— Опять мнения, сказанные на основе других мнений. Данный вопрос экспериментальный. Он решается следующим образом. Получается вирус (конкретно вариант «Омикрон» или любой другой вариант интереса), и в условиях лаборатории выясняется, насколько быстро он инактивируется сывороткой крови людей, привитых той или иной вакциной. В качестве сравнения используется препарат исходного вируса, против которого была разработана вакцина.
Безусловно, в течение недели-двух будут получены цифры. Но можно сказать с уверенностью, что с какой-то эффективностью антитела, выработанные в ответ на существующие действующие прививки, будут этот вирус подавлять. Прошлый опыт показывает, что все прививки, несмотря на то, что они разработаны на основании исходного, уханьского, варианта, подавляют и другие варианты, пусть и чуть менее эффективно в рамках развития вируса: альфа-, бета-, гамма-, дельта-вариантов.

«Нескончаемый круговорот с точки зрения эволюции вируса будет всегда»

— Разработчики  «Спутника» уже делают заявления, что он будет эффективным в борьбе против «Омикрона».
— Эти заявления могут быть сделаны только после проведения описанного выше опыта с использованием сыворотки крови людей, иммунизированных «Спутником». Но если «Омикрона» в России в массовом масштабе нет, то опыт, который необходим для того, чтобы обосновать утверждения разработчиков «Спутника» пока что не может быть проведен. Значит, это утверждение ни на чем не основано. Безусловно, какое-то подавление будет. Но какое именно мы не знаем. Более того, учитывая, что «Омикрон» возник в ЮАР, где уровень вакцинации даже ниже, чем в России, очевидно, что наличие вакцин никакого влияния на развитие этого вируса не оказало.
— Ведущие фармацевтические компании мира уже работают над адаптацией своих вакцин к штамму «Омикрон» — и Pfizer, и AstraZeneca. В институте имени Гамалеи тоже занялись модификацией. Обещают запустить в производство Sputnik Omicron и выпустить несколько сотен миллионов бустерных доз к 20 февраля 2022 года.
— Доказанной необходимости адаптировать существующие вакцины к «Омикрону» сегодня нет. Но технически это легко осуществимо стандартными методами молекулярного клонирования ДНК. Производные вакцины будут приводить к образованию в клетках человека S-белка, идентичного S-белку нового варианта вируса. В случае вакцины типа «КовиВака» для того, чтобы это сделать, нужно получить новый вариант вируса и подобрать условия для его наработки в лаборатории. Это может быть сложно и долго. Но в любом случае любая вакцина после такого рода изменений должна быть каким-то образом исследована. А если кто-то опять решит срезать углы, как это было со «Спутником», скорее всего, это создаст дополнительные проблемы, а не решит проблемы по крайней мере на международном рынке. Кроме того, о скорейшем производстве сотен миллионов доз «Спутника», нового или старого, речи не идет. У нас в стране нет производственных мощностей для этого.
— А достаточно ли сегодня сведений о новом штамме, чтобы модифицировать к нему вакцины, если понадобится?
— Технически изменить аденовирусную или мРНК-овую вакцину не представляет проблем. Но потребуется затем доказать, что измененная вакцина продолжает работать и против основного на сегодня варианта «Дельты», и против нового варианта вируса, и что она работает против нового вируса лучше, чем существующие вакцины, а иначе зачем было огород городить?
— С другой стороны, появляются заявления, что благодаря «Омикрону» пандемия может пойти на спад.
— Не знаю, на основании чего сделаны такие выводы. Почему, например, благодаря «Дельте» пандемия не пошла на спад? Появление нового штамма вовсе не означает, что пандемия должна схлопнуться. Я не вижу для этого причин.
— Об этом говорит, в частности, главный научный сотрудник НИЦ эпидемиологии и микробиологии имени Гамалеи, вирусолог Анатолий Альтштейн.
— Наверное, за это мнение должен Альтштейн отвечать. Он должен объяснить, почему он так думает.
— Важно, чтобы вы это прокомментировали. Эти же заявления цитируют везде и всюду. В интернете, по Первому каналу в прайм-тайм.
— Я не могу комментировать слова Анатолия Давидовича. Почему «Омикрон» не будет вызывать тяжелых форм? На чем основано это утверждение?
— У людей с ослабленным иммунитетом всегда будут появляться новые мутации?
— Безусловно. Поскольку вирус циркулирует и размножается, новые варианты появляются автоматически, как ошибки при копировании вирусных геномов. Это естественный процесс.
— Значит, будет нескончаемый круговорот?
— Круговорот нескончаемый с точки зрения эволюции вируса будет всегда. Эволюция никогда не останавливается.
— Я по поводу пандемии.
— Люди с ослабленным иммунитетом могут являться источником появления вариантов вирусов с большим количеством мутаций. Но большее количество мутаций не означает, что данный вирус становится опаснее для окружающих. Можно вспомнить пациентку из Санкт-Петербурга — у нее возникали все новые и новые варианты. Конечный вариант был приспособлен к тому, чтобы наиболее эффективно уходить от остаточного иммунитета женщины. У нее не было антител, имелся только клеточный иммунитет. Но такой вариант не распространился никуда и не представлял особой опасности.
...

© https://www.business-gazeta.ru/article/531885

--------------------

Tinkoff: бесплатные навсегда дебетовая Black (по 28.02.22 после покупки от 300₽) и кредитная Platinum (по 31.01.22).

[• Anti Fake]

Новый омикрон-штамм коронавируса выявлен у двух человек, прибывших в Россию из ЮАР, сообщили журналистам в понедельник в пресс-службе Роспотребнадзора.
"У двух пациентов с положительным ПЦР-тестом, полученным в первые сутки пребывания в обсерваторе, в результате полногеномного секвенирования, проведенного ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, подтвержден штамм "омикрон", - говорится в сообщении.

© https://tass.ru/obschestvo/13120625

--------------------

Tinkoff: бесплатные навсегда дебетовая Black (по 28.02.22 после покупки от 300₽) и кредитная Platinum (по 31.01.22).

[• Anti Fake]

Ну что, появились первые лабораторные данные по способности омикрона уходить от антител после вакцинации. Коротенький препринт, буквально чуть расписанный результат пары экспериментов выложили ученые из лаборатории Алекса Сигала из Африканского института наук о здоровье (Africa Health Research Institute) в ЮАР. Они работали с настоящим вирусом и проверяли, способна ли плазма привитых вакциной от Pfizer предотвращать заражение клеток (такие эксперименты называются экспериментами по проверке нейтрализации). Часть добровольцев до и после прививки не болели, часть болели.

Результат эксперимента показан на картинке к посту, это иллюстрация из препринта. D614G – старый штамм вируса, гулявший еще до альфы и дельты, и плазма вакцинированных на 50% снижала заражение им клеток  даже при разбавлении в 1321 раз (порог в 50% – стандартные условия для реакции нейтрализации, иногда еще делают 90%). Справа на иллюстрации омикрон, и для того, чтобы не дать ему заразить 50% клеток, плазму можно разбавить только в 32 раза. То есть мы видим снижение эффективности в 41 раз. Для тех, кто вакцинировался и переболел (зеленые линии), снижение нейтрализации чуть меньше, но все равно очень существенное, намного больше, чем для предыдущих штаммов – например, для дельты оно составляло 8 раз.
Иначе говоря, как и предсказывали эксперты, омикрон так сильно изменился по сравнению с предковыми вариантами, что существенная часть антител, выработанных против них, перестала узнавать его. Неудивительно, что среди заразившихся им много вакцинированных. По всей вероятности, бустер снижает риск подхватить омикрон, но не в той же мере, что для дельты или других штаммов. То есть заражаться омикроном будут все: и невакцинированные, и вакцинированные. В такой ситуации не приходится сомневаться, что омикрон будет быстро распространяться. Если для предыдущих штаммов привитые были серьезным препятствием – их сложнее заразить и в них сложнее размножиться до концентраций, необходимых для инфицирования других – то для омикрона они являются легкой добычей.
Впрочем, сыворотки некоторых вакцинированных и вакцинированных и переболевших нейтрализовали омикрон по-прежнему сносно. Так что индивидуальных особенностей иммунного ответа никто не отменял.
Теперь вопрос, каково будет течение болезни. Для дельты защита от тяжелого течения для привитых составляет около 90% – настолько снижается риск заразившихся привитых попасть в больницу по сравнению с заразившимися непривитыми. Каковы будут цифры для омикрона – неизвестно, но, вполне вероятно, что защита от тяжелого течения после вакцинации останется высокой. Пока новостей о смертях от омикрона нет, но это не означает, что так будет и дальше: прошло недостаточно времени (заразившиеся не умирают мгновенно), выборка в ЮАР, где омикрон гуляет дольше всего, отличается от выборки западных стран как по возрасту, так и по статусу вакцинирования, наконец, выборка еще просто слишком мала. Так что ждем.

© https://www.facebook.com/irina.yakutenko/po...159534230609800

--------------------

Tinkoff: бесплатные навсегда дебетовая Black (по 28.02.22 после покупки от 300₽) и кредитная Platinum (по 31.01.22).

[• Anti Fake]

https://www.youtube.com/watch?v=hhzKCfSjnQo

Омикрон уходит от антител после вакцинации и болезни. Это конец или еще нет?

--------------------

Tinkoff: бесплатные навсегда дебетовая Black (по 28.02.22 после покупки от 300₽) и кредитная Platinum (по 31.01.22).

[• SeaEng]

Чуточку обнадеживающих новостей, существующие вакцины все еще могут работать против "Омикрона" и новый локдаун не потребуется. Надеюсь Спутник тоже скоро опубликуют результаты их исследований

Компания Pfizer и ее партнер - компания BioNTech в среду заявили, что трехкомпонентный курс их вакцины против COVID-19 успешно нейтрализовал новый вариант «омикрон» в ходе лабораторных испытаний и что при необходимости они смогут представить обновленную вакцину уже в марте 2022 года.

Компании отметили, что при введении двух доз их вакцины наблюдалось значительное снижение нейтрализующих антител, но третья доза усилила эти антитела в 25 раз.

«Первая линия защиты, обеспечиваемая двумя дозами вакцины, может быть прорвана, и для восстановления защиты потребуется три дозы», – заявила на пресс-конференции глава медицинского отдела BioNTech Озлем Тюречи. Компании предполагают, что две дозы все равно могут предотвратить заболевание в тяжелой форме.

Для своего анализа компании использовали так называемый псевдовирус, которому биоинженерным методом присвоили характерные для «омикрона» мутации. Кровь брали у участников исследования через три недели после получения второй дозы вакцины или через месяц после третьей.

Пока нет значительного количества данных о том, как противостоят новому варианту вакцины от компаний Moderna, Johnson & Johnson и других производителей, но ожидается, что они опубликуют свои данные в течение нескольких недель.

[• Tiha]

По прогнозам один из благоприятных сценариев : вирус более контактен , но последствия гораздо легче , чем у Дельты. Возможно он ослабевает. Но это всего лишь один из прогнозов.

Забавно, что к вакцинам сразу претензии что исследования были всего пол года-год и возможны скрытые побочки: бесплодие там, вайфай раздаваться начнет или произойдет наложение числа Зверя.
А про Омикрон по которому не то что никаких исследований пока нет, даже переболевших толком еще не навыявляли, но уже куча выводов.

[• Anti Fake]

Чуточку обнадеживающих новостей

Ключевое (как я понял из видео с Якутенко выше):

Для своего анализа компании использовали так называемый псевдовирус

Ну и новости не такие уж и радужные:

О ситуации в крупнейшем ковидном госпитале Йоханнесбурга рассказывает профессор Матива (Prof Rudo Mathivha), заведующая ОРИТ госпиталя Барагванат. Теперь речь коснулась детей с омикрон-штаммом коронавируса. Приводим основные тезисы.

• В больницу ежедневно поступает 5-10 детей в возрасте младше 12 лет, а также преимущественно невакцинированные молодые люди в возрасте до 40 лет и несколько человек в возрасте 40-50 лет. Беременные женщины и раньше болели ковидом, но бессимптомно - сейчас они попадают в госпиталь с симптомами.
• В прошлые волны СOVID-19 у детей лечился как любая вирусная инфекция, дети редко попадали в госпиталь. Сейчас детей привозят в больницу с умеренным и тяжелым течением ковида, им нужна кислородная поддержка, поддерживающая терапия.
• Повсюду закрываются начальные школы из-за вспышек и кластеров ковида, родителям предлагают забрать детей домой до следующего года - без сообщений в новостях.
• Впервые за все время работы ковидного отделения умер от коронавируса здоровый 15-летний ребенок:

  "Но что действительно разбило мне сердце вчера, это 15-летний ребенок, который был здоров [до ковида]. Двухдневная история лихорадки, поступает в больницу, дает положительный результат на Covid, и ухудшается буквально на наших глазах, и ничего, никакая поддерживающая терапия, не смогло ей помочь. Это первый известный мне случай умершего от ковида ребенка, у которого не было сопутствующих заболеваний. В прошлом году мы потеряли 11-летнего ребенка, но в том случае у пациента была хроническая болезнь почек, сопутствующее заболевание высокого риска", - репортировала профессор.

https://www.youtube.com/watch?v=6bIOgcoFMck

More children admitted with COVID-19 symptoms to hospitals: Prof Rudo Mathivha

© https://www.provrach.ru/news/6416-apdeyt-ot...ovid-19-u-detey
Вероятно, после Нового года школьников ждет удаленка.

--------------------

Tinkoff: бесплатные навсегда дебетовая Black (по 28.02.22 после покупки от 300₽) и кредитная Platinum (по 31.01.22).

[• Tiha]

Интересно, что хотел выразить поставивший минус предыдущему сообщению?
Там ведь фактически нет суждений, человек просто поделился новостями.

[• Anti Fake]

Избыточная смертность в ЮАР из-за «омикрона» взлетела вдвое.
Она в 12 раз превысила официальную смертность от коронавируса в Южной Африке. Эта информация идет вразрез с высказанными ранее оценками о «мягкости» омикрон-штамма и указывает на то, что вскоре мир и Россию ждет аналогичный рост смертности.
Сразу после идентификации омикрон-штамма во второй половине ноября многие врачи и представители властей ЮАР заявляли, что с ним болезнь протекает мягче, чем при дельта-штамме. Аналогичную позицию, пусть и с осторожностью, занимал глава Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) Энтони Фаучи. Ученые и врачи российского происхождения, работающие в США, не остались в стороне от этого тренда: Константин Чумаков из той же FDA даже назвал новый штамм «живой вакциной» — чем-то, чем все переболеют, но без опасных последствий, зато получат иммунитет от коронавируса. Высказывались идеи, что смертность с новым штаммом может снизиться до «примерно равной гриппу» и это будет означать фактический конец изматывающей пандемии.
Однако, как уже писал Naked Science, некоторые факты указывали на слабость подобных идей. Во-первых, даже по официальной статистике, в ЮАР все еще умирали от Covid-19 — 174 человека за, например, период с 28 ноября по 4 декабря. Доля омикрон-штамма там в эту неделю уже была равна 100%, то есть говорить, что от нового варианта вируса нет смертей, не приходилось. Во-вторых, ЮАР в 1990-х испытала понятные процессы деградации ряда общественных институтов, включая медицину (что-то похожее было в те же годы в России, но по другим понятным причинам). В итоге его система здравоохранения (на графике) по качеству не лучшая в мире. Полнота учета коронавирусных смертей в странах с проблематичным здравоохранением низка.
Поэтому выход данных по избыточной смертности в ЮАР за 28 ноября — 4 декабря имеет большое значение: он позволяет оценить реальное число жертв «омикрона», вне зависимости от неспособности южноафриканской медицины точно диагностировать причину смерти таких людей. Оказалось, за эту 48-ю неделю года в ЮАР умерли на 2076 человек больше, чем в эти же даты в другие годы. Это означает рост смертности на 21,9% от нормы. В официальном отчете по местной статистике попытались применить трюк по затушевыванию цифр. Там заявили, что статистически значимая часть избыточной смертности вросла на 16,11%, и в таком виде передали информацию об уровне избыточной смертности в международные организации и компании, ведущие ее учет. Однако в других странах подобные методы «оптимизации учета» не применяют, поэтому в сравнительных целях такая корректировка некорректна.

Третья колонка слева показывает число избыточных смертей по неделям в ЮАР. четвертая колонка показывает накопленное количество избыточных смертей с начала эпидемии / ©[color=silver]samrc.ac.za
Две тысячи избыточных смертей в месяц — это максимум для ЮАР с сентября этого года. Особенно важно то, что эпидемия «омикрона» там находится все еще в самой начальной стадии, поскольку он появился в заметных количествах только в ноябре. Хотя пока избыточная смертность в 21,9% выглядит не очень плохо, в самом ближайшем будущем эти цифры могут кратно возрасти. Всего в республике с начала эпидемии уже есть 276 тысяч избыточных смертей. Летом 2020-го там была вспышка исходного «коронавируса-уханьца», зимой — 2020-2021 — южноафриканского штамма «бета», летом этого года — «дельты», а теперь — «омикрона».
Интересно, что южноафриканская официальная смертность от коронавируса за период с 28 ноября по 4 декабря составила всего 174 человека — в 12 раз меньше числа избыточных смертей. Значит, уровень занижения официальной коронавирусной смертности в этой стране так велик, что опираться имеет смысл только на данные по общей смертности.

На графике легко видеть, что после падения апартеида в ЮАР резко упала продолжительность жизни, в значительной степени из-а проблем с медициной. Восстановление до апартеидного уровня заняло более четверти века. В таких условиях неспособность местной медицины полностью учесть жертв коронавируса достаточно ожидаемая. Хотя в России 1991 года и его последствия ударили по продолжительности жизни не так резко, как в ЮАР, сходные проблемы есть и у нас (данные Оперштаба многократно недоучитывают число жертв коронавируса) / © OurWorldInData
Ранее власти России (министр здравоохранения Мурашко) отмечали, что в период эпидемии вся избыточная смертность — коронавирусная. Осложнения, вызванные Covid-19, ведут к резкому росту частоты инфарктов и инсультов даже у тех, кто перенес его бессимптомно (и сам не знал об этом, пока ему не сделали ПЦР-тест после госпитализации «по сердцу»). На конец минувшего ноября в России избыточная смертность за время эпидемии составила 984 тысячи человек — вчетверо выше, чем в ЮАР. За этот месяц в нашей стране было 116 тысяч избыточных смертей — рекорд, превышающей любую месячную цифру избыточных смертей после мая 1945-го.
Известно, что «омикрон» заражает вакцинированных и переболевших другими вариантами коронавируса намного эффективнее, чем любой его штамм-предшественник Исходя из скорости роста избыточных смертей в ЮАР и учитывая, что «омикрон» уже попал к нам, нельзя исключать, что скоро и Россия перекроет исторический рекорд избыточной смертности ноября 2021-го.
Эффективных средств противостояния «омикрону» пока нет: хотя НИЦ имени Гамалеи создал специализированный под «омикрон» вариант «Спутника», необходимость в его испытаниях (на них требуются многие недели) означает, что ранее весны эту вакцину не удастся применить массово.

© https://naked-science.ru/article/medicine/omicroned

https://www.youtube.com/watch?v=9tQ1zok-D14

Анча Баранова: НОВОЕ ОБ «ОМИКРОНЕ» - есть плохая и хорошая новость

--------------------

Tinkoff: бесплатные навсегда дебетовая Black (по 28.02.22 после покупки от 300₽) и кредитная Platinum (по 31.01.22).

[• SeaEng]

Интересно, что хотел выразить поставивший минус предыдущему сообщению?
Там ведь фактически нет суждений, человек просто поделился новостями.

Тут это в порядке вещей, на этом форуме полно людей, кто минусует и даже слова не пишет почему, зачем, как будто в том мифе про опыт на обезьянками, где "никто не знает почему, но тут так принято" .

[• Reggen]

Чуточку обнадеживающих новостей, существующие вакцины все еще могут работать против "Омикрона" и новый локдаун не потребуется. Надеюсь Спутник тоже скоро опубликуют результаты их исследований

Я думаю, наиболее волнительным является то, выдают ли существующие вакцины QR-код от "Омикрона" или нет, а не то, что там происходит с имунной системой

--------------------

THMWSDLTDTDY.

[• Anti Fake]

Эффективность вакцин и переболевания против омикрона (препринт!)
Информация потихоньку подъезжает, но основные результаты остаются неизменными: на первом месте - гибридный иммунитет, причем чемпион - вакцина после болезни, вице-чемпион - болезнь после вакцины. За ними идет комбинированный иммунитет из разных типов вакцин.
Бусты, судя по результатам исследований, эту ситуацию должны улучшить до приемлемой. Причем это касается как привитых, так и переболевших. Последних - в особенности, гибридный иммунитет в пандемию - наше всё, похоже.

© https://vk.com/a.vodovozov?w=wall15768560_84079

Сообщение отредактировал Anti Fake - Dec 15 2021, 16:25

--------------------

Tinkoff: бесплатные навсегда дебетовая Black (по 28.02.22 после покупки от 300₽) и кредитная Platinum (по 31.01.22).